lunes, 18 de mayo de 2020

Pen//último Brainstorming!!!

Hola a todos:
Ya estamos a punto del colofón definitivo y tan solo nos queda un pequeño empujón...
Tras definir el título y proponer una introducción del trabajo por mi parte, tan solo hemos de entender estras tres figuras claves en nuestro trabajo a presentar y proponerles una leyenda:
Así, la Figura 3, ejemplifican distintos tutoriales del manejo del clone manager...

Figure 3: Examples of clone manager tutorial (A)... and (B)...

Tenemos una siguiente figura, ya en el apartado de resultados... El resultado de analizar mediante CRISPRCAS finder todo el genoma de VV5...

Figure 4: Analysis with CRISPRCas finder tool of 5.2 Mb of V. vulnificus VV5 genome.

Y por último, la figura más compleja y que resume nuestro análisis dándole un valor biológico a lo que hemos encontrado...

Figure 5: Characteristics of the complete CRISPR System found in VV5 genome...

Y en base a todo ello, debemos definir las conclusiones de nuestro trabajo.
Ánimo!!!!

¡¡¡ Qué las tenemos claras !!!

Hip, hip Hurra!!!
CRISPR Team!!!

viernes, 1 de mayo de 2020

Poniéndonos las Pilas!!! - Todo un hervidero II (Mayo 2020)

Hola a todos:
El miércoles pasado (29 de abril) tuvimos nuestra primera sesión virtual (no será la última). Fue como siempre una sesión intensa en la que planteamos la posibilidad de terminar nuestro proyecto. Es decir, plantearnos todo un reto: 

Escribir la comunicación.

El motivo de ello no es otro, que los proyectos PIIISA en la EEZ de este año continúan. 

Tenemos hasta el 27 de mayo para presentar nuestra comunicación. 

Por tanto nos pondremos las Pilas para ello. 


A la reunión asistimos: Marta, Marina y Nicolás. Junto a vuestro tutor Ramón. Tras un serio “brainstorming”, decidimos que podíamos llevar a cabo un manuscrito (en recursos, tenemos varios ejemplos de manuscritos anteriores que pueden ayudaros a entender que no andamos lejos: 2014, 2015 y 2016).
Importante: El pasado miércoles tomamos la decisión con cuál de los títulos que os proponía nos íbamos a sentir más cómodos en la comunicación.


Efectivamente, lo sugirió Marta (o Marina, no sé) y creo que es el adecuado:
“How to know if a bacteria contains CRISPR elements?”
Porque eso es realmente lo que hemos vislumbrado en este proyecto. O no???

(i)   Sabemos qué son las siglas CRISPR.
(ii)  Sabemos qué herramientas se usan para descubrirlos.
(iii) Sabemos interpretar la información que dan.


 Así que manos a la obra:
Estos días iré subiendo al blog. Distintas imágenes que formaran parte de la comunicación y que quiero que escribáis la leyenda de las figuras (lo que significan). 

A modo de ejemplo, probablemente la primera figura de la introducción de nuestro trabajo:


Figure 1: Diagram of a CRISPR-cas system. The leader sequence, between 20 and 534 nucleotides in length, contains the promoter sequence for transcription of the CRISPR array. The repeats (diamonds) are between 21 and 50 nucleotides in length (mean of 31 nt), while the spacers (colored squares) are between 17 and 84 nucleotides (mean of 36 nt). In the vicinity of the array, the presence of Cas genes (in white) is frequent.

Para esto último, escribir la leyenda de las figuras que tengamos en el trabajo, he dividido al grupo en tres parejas, ya que no todos pudimos estar en la reunión el pasado miércoles:
Pareja A: Marta y Maria
Pareja B: Marina y Daniel
Pareja C: Nicolás y Sara.

Contactad entre vosotros!!!!.  En las próximas entradas, incluido los correos os enviaré la información para ello.
¿Qué es lo que tenéis que hacer de momento?

Repasar el blog de atrás a adelante y empararos de todo lo que hemos hecho (sobre todo en aquellas sesiones tan intensas) y recordarlo.


Por último, y lo subrayo. Nuestra comunicación tiene un apartado (echad un vistazo en recursos y veréis lo que pusieron otros alumnos otros años):

My OWN IDEAS
Tenemos una nueva cita en breve!!!!
AUPA CRISPR team!!!

En ella cada uno tendrá que expresar su experiencia en este proyecto.

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