jueves, 15 de octubre de 2020

El Premio Nobel de Química de este año 2020

Hola a todos de nuevo.

Y es que… vaya año. Primero nuestro proyectazo, después la Pandemia, (que todavía la tenemos muy encima) y varios premios (CEA, publicaciones…). Y como premio extra: la pasada semana se anunciaron los premios Nobel de este año. Uno de ellos el de Química ha galardonado la tecnología CRISPR, en concreto a las investigadoras J Doudna y E Charpentier por haber demostrado las tijeras genéticas más precisas encontradas hasta ahora: la herramienta CRISPR/Cas9.

 
Fig. 1: Portada de los premios Nobel de química de este año.

 

Y es que en este blog sabemos mucho de eso ¿¿o no?? Creo que debéis de ser los alumnos de secundaria que mejor entienden el por qué de este Nobel.


 
Figura 2: Cas9 puede programarse mediante un RNA guía para degradar de manera específica una diana de DNA


El presidente del comité Nobel de Química, Claes Gustafsson, ha emitido en un comunicado la importancia de este descubrimiento: “Hay un poder enorme en la tecnología CRISPR, que nos afecta a todos. No solo ha revolucionado la ciencia básica, sino que también dará lugar a nuevos tratamientos médicos innovadores”.

https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2020/prize-announcement/ 

Y es que este premio Nobel se basa sobre todo a un trabajo que ambas investigadoras publicaron en el año 2012 en el que demuestran la efectividad del sistema CRISPR denominado Cas9 en la edición genética (lo podeís consultar en el área de recursos). El comité Nobel ha dejado a un lado trabajos previos de Francis Mojica y otros sobre la funcionalidad biológica de estos sistemas. 

Y sin embargo como comenta el Dr F. Mojica:  

El hecho de que se haya concedido un premio Nobel por el desarrollo de una aplicación derivada de investigaciones que germinaron en este país, es sin duda un gran triunfo de la ciencia española que no necesita de una medalla que lo certifique”.

Así que como viene siendo habitual.
Hip, hip hurra!!!
CRISPR Team.

jueves, 24 de septiembre de 2020

Ciencia en Acción 2020 - No presencial

Hola a todos:

Como ya sospechábamos, este curso 2020/2021 va a ser todo un desafío en nuestro instituto, nuestra ciudad,  nuestro país, etc.. Y como ejemplo lo tenemos en nuestro primer escenario: 

va a ser el primer congreso de Ciencia en Acción “virtual” no presencial

Lo podremos seguir desde nuestras casas, desde nuestros móviles, desde cualquier sitio … y además quedará grabado en youtube.

El congreso se podrá seguir “gratis” a través de este enlace:

https://www.youtube.com/playlist?list=PLp0EWP-kPSqvHll4DxTOln5ZhIdi9Cozc

Figura: Pantallazo del aspecto del enlace al congreso


El congreso está dividido en distintas secciones /paneles que abarcan multitud de trabajos realizados a lo largo del curso pasado y que eligieron la opción no-presencial para su presentación. Aunque nosotros no presentaremos aquí nuestro trabajo habrá proyectos chulos que no nos deberíamos perder… . 

Figura: Programa del congreso.

El haber sido galardonados nos da opción de asistir (esperemos) al próximo en el año 2021.  En recursos tenéis el libro entero de actas del congreso (LIBRO DE ACTAS CEA XXI (1)).

Portada del Libro de actas. Lo teneis en recursos. Nuestra comunicación está en la página 112.

Los días Viernes 2 de Octubre, Sábado 3 y Domingo 4 no deberíamos perdernos y asistir… Y de nuevo, debemos de sentirnos muy orgullosos de haber participado en esta “aventura”.

Hip, hip, hip, Hurrra!!!!! CRISPR team!!!



martes, 7 de julio de 2020

Ciencia en Acción 2020

Hola a todos:
El pasado Lunes 6 de Julio se hizo público el fallo de los premiados a participar en la XXI Edición del Congreso Internacional promovido por Ciencia en Acción. 



Señores!!!!, han reconocido nuestro trabajo como digno merecedor del Primer premio en la Modalidad de Biología (Premio patrocinado por la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular):




En este enlace, podéis ver los temas y calidad de otros proyectos premiados tras el fallo del Jurado: https://cienciaenaccion.org/resolucion-del-jurado-de-ciencia-en-accion-xxi-opcion-presencial/
Debemos sentirnos muy orgullosos. Enhorabuenísima a todos los participantes de este Proyecto que no para de sorprendernos.



jueves, 18 de junio de 2020

We've got it!!!

Hola a todos:
Por fin salió el volumen número 9 de la revista High School Students for Agricultural Science Research con nuestra contribución a la Investigación en la Estación Experimental del Zaidín:


Portada del volumen 9 de la revista: High School Students for Agricultural Science Research

Lo conseguimos. Nuestro trabajo es uno de los 5 publicados en este número. Enhorabuena!!! Con el tiempo nos daremos cuenta de lo importante que es haber formado parte de este volumen. Un volumen que el COVID19 ha hecho muy, muy , muy especial.

Vuestra primera publicación científica:
Amorós-Monte N, Martín-Jiménez D, Marta Nieves-Vallejo M, Puig-Aguiar MD, López-Laazibi S, Fijo-Martín M & Martínez-Abarca F. (2020) “How to know if a bacterium contains CRISPR elements?” in “High School Students for Agricultural Science Research vol. 9.  Editores: Alché JD, et al. Estación Experimental del Zaidín - CSIC (Granada). pp: 3-13.  ISSN: 2340-9746.
Os animo a que le echéis un buen vistazo a todas sus páginas, los trabajos son variados y todos han tenido ese doble mérito de combinar experimentos antes del COVID y sesiones ‘online’ durante y post-COVID. Este es el enlace:
https://ucc.eez.csic.es/educacion-cientifica/high-school-students-for-agricultural-science-research/
Os animo a que escribáis comentarios de cómo os sentís tras el verdadero premio de este trabajo: Su publicación.

lunes, 18 de mayo de 2020

Pen//último Brainstorming!!!

Hola a todos:
Ya estamos a punto del colofón definitivo y tan solo nos queda un pequeño empujón...
Tras definir el título y proponer una introducción del trabajo por mi parte, tan solo hemos de entender estras tres figuras claves en nuestro trabajo a presentar y proponerles una leyenda:
Así, la Figura 3, ejemplifican distintos tutoriales del manejo del clone manager...

Figure 3: Examples of clone manager tutorial (A)... and (B)...

Tenemos una siguiente figura, ya en el apartado de resultados... El resultado de analizar mediante CRISPRCAS finder todo el genoma de VV5...

Figure 4: Analysis with CRISPRCas finder tool of 5.2 Mb of V. vulnificus VV5 genome.

Y por último, la figura más compleja y que resume nuestro análisis dándole un valor biológico a lo que hemos encontrado...

Figure 5: Characteristics of the complete CRISPR System found in VV5 genome...

Y en base a todo ello, debemos definir las conclusiones de nuestro trabajo.
Ánimo!!!!

¡¡¡ Qué las tenemos claras !!!

Hip, hip Hurra!!!
CRISPR Team!!!

viernes, 1 de mayo de 2020

Poniéndonos las Pilas!!! - Todo un hervidero II (Mayo 2020)

Hola a todos:
El miércoles pasado (29 de abril) tuvimos nuestra primera sesión virtual (no será la última). Fue como siempre una sesión intensa en la que planteamos la posibilidad de terminar nuestro proyecto. Es decir, plantearnos todo un reto: 

Escribir la comunicación.

El motivo de ello no es otro, que los proyectos PIIISA en la EEZ de este año continúan. 

Tenemos hasta el 27 de mayo para presentar nuestra comunicación. 

Por tanto nos pondremos las Pilas para ello. 


A la reunión asistimos: Marta, Marina y Nicolás. Junto a vuestro tutor Ramón. Tras un serio “brainstorming”, decidimos que podíamos llevar a cabo un manuscrito (en recursos, tenemos varios ejemplos de manuscritos anteriores que pueden ayudaros a entender que no andamos lejos: 2014, 2015 y 2016).
Importante: El pasado miércoles tomamos la decisión con cuál de los títulos que os proponía nos íbamos a sentir más cómodos en la comunicación.


Efectivamente, lo sugirió Marta (o Marina, no sé) y creo que es el adecuado:
“How to know if a bacteria contains CRISPR elements?”
Porque eso es realmente lo que hemos vislumbrado en este proyecto. O no???

(i)   Sabemos qué son las siglas CRISPR.
(ii)  Sabemos qué herramientas se usan para descubrirlos.
(iii) Sabemos interpretar la información que dan.


 Así que manos a la obra:
Estos días iré subiendo al blog. Distintas imágenes que formaran parte de la comunicación y que quiero que escribáis la leyenda de las figuras (lo que significan). 

A modo de ejemplo, probablemente la primera figura de la introducción de nuestro trabajo:


Figure 1: Diagram of a CRISPR-cas system. The leader sequence, between 20 and 534 nucleotides in length, contains the promoter sequence for transcription of the CRISPR array. The repeats (diamonds) are between 21 and 50 nucleotides in length (mean of 31 nt), while the spacers (colored squares) are between 17 and 84 nucleotides (mean of 36 nt). In the vicinity of the array, the presence of Cas genes (in white) is frequent.

Para esto último, escribir la leyenda de las figuras que tengamos en el trabajo, he dividido al grupo en tres parejas, ya que no todos pudimos estar en la reunión el pasado miércoles:
Pareja A: Marta y Maria
Pareja B: Marina y Daniel
Pareja C: Nicolás y Sara.

Contactad entre vosotros!!!!.  En las próximas entradas, incluido los correos os enviaré la información para ello.
¿Qué es lo que tenéis que hacer de momento?

Repasar el blog de atrás a adelante y empararos de todo lo que hemos hecho (sobre todo en aquellas sesiones tan intensas) y recordarlo.


Por último, y lo subrayo. Nuestra comunicación tiene un apartado (echad un vistazo en recursos y veréis lo que pusieron otros alumnos otros años):

My OWN IDEAS
Tenemos una nueva cita en breve!!!!
AUPA CRISPR team!!!

En ella cada uno tendrá que expresar su experiencia en este proyecto.

jueves, 23 de abril de 2020

CONFINADOS PERO ACTIVOS - Todo un hervidero (Abril 2020)

Hola a todos:
Tras un tiempo confinados, adaptándonos y tomando conciencia de la nueva realidad, no deja de ser curioso comprobar que tenemos todo el tiempo del mundo y al mismo tiempo nos falta tiempo para las múltiples tareas "on line" en las que andamos embarcados...



Y es que en estos tiempos el mundo parece un hervidero, y la ciencia incluso más que cualquier otra labor. De hecho y como habréis oído en las noticias varios centros de Investigación en Biomedicina, en todo el mundo, se han puesto en la labor de adaptar sus investigaciones a incrementar el conocimiento URGENTE sobre la biología, clínica, desarrollo de tecnologías etc. sobre este coronavirus, el SARS-cov2. En España todo este esfuerzo está siendo coordinado por el Instituto de Salud Carlos III.


Y como no podía ser de otro modo, el mundo de los CRISPR tampoco se está quieto...
En este sentido, seguro que habéis escuchado que uno de los aspectos críticos en relación a esta pandemia es la falta de información sobre la expansión del virus SARS Cov 2 en la población. Y ello es debido a la dificultad de hacer test fiables, rápidos y a un buen número de individuos de la población.

 Fuente: Diario La Opinión de Málaga. Toma de muestras para el análisis del SARS cov-2.

Os animo a que leáis esta noticia aparecida en varios medios hace unos días: Una técnica experimental diagnostica la covid en 40 minutos.

 Fuente: diario El País.



Investigadores de EE UU están desarrollando un test rápido para la covid-19 que puede diagnosticar una infección en unos 40 minutos. La nueva tecnología  es aún experimental y se basa en la revolucionaria técnica de edición genética CRISPR. Fuente El País 21/Abril de 2020.
Aunque este test todavía requiere de una mayor investigación y desarrollo, me gustaría que leyéramos la noticia en profundidad y de nuevo la relacionáramos con la investigación de nuestro proyecto. Premio, al primero que me responda… a esta y sobre todo a la anterior entrada!!!
Siempre es bueno, relacionar la investigación que estamos haciendo con su posible y real aplicabilidad. Un ejemplo más de la "serendipia" en Ciencia.

Aupa, CRISPR Team!!!!
Que con sólo un último esfuerzo podríamos cerrar nuestro proyecto!!!!

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